Esta reserva protege uno de los lugares más visitados de la región costera central de Ecuador: la Puntilla de Santa Elena. La Chocolatera y la zona marítima adyacente. La Puntilla, como también se le llama, es el punto más extremo de la costa continental de América del Sur, que separa la Bahía de Santa Elena del Golfo de Guayaquil. Las aguas de la reserva son la fuente de ingresos para muchas comunidades pesqueras y juegan un papel importante en la protección y restauración de las pesquerías que han disminuido a lo largo de los años debido a la sobrepesca. Además del área marina, la reserva incluye playas, acantilados y una pequeña área de matorrales y bosques costeros secos.